L'Office fédéral de la protection de la population (OFPP) est réparti sur plusieurs sites. Son siège se trouve à la Guisanplatz 1B à Berne. Celui-ci est accessible par le tram n° 9 au départ de la gare de Berne ou de la gare RER de Berne Wankdorf, située à proximité. La Guisanplatz peut également être rejointe par différentes lignes de bus régional qui desservent les environs du nouveau centre administratif. Il y a peu de places de parc à disposition pour les visiteurs.

Le Laboratoire de Spiez est situé à Spiez, dans l’Oberland bernois, et la Centrale nationale d'alarme (CENAL) à Zurich. L'OFPP dispose également d'une infrastructure de formation moderne avec le Centre fédéral d'instruction de Schwarzenburg (CFIS).